การทำงานของคอลัมน์การกลั่นต้องมีการควบคุมความสมดุลของวัสดุ ความสมดุลของไอ-ของเหลว และความสมดุลของความร้อน
ความสมดุลของวัสดุหมายถึงหลักการที่ว่าปริมาณของวัสดุที่เข้าสู่คอลัมน์ต่อหน่วยเวลาควรเท่ากับผลรวมของจำนวนวัสดุที่ออกจากคอลัมน์ ความสมดุลของวัสดุสะท้อนถึงกำลังการผลิตของคอลัมน์ และควบคุมโดยอัตราการป้อนและอัตราการระบายด้านบนและด้านล่างเป็นหลัก ในระหว่างการดำเนินการ การเปลี่ยนแปลงในความสมดุลของวัสดุจะสะท้อนให้เห็นโดยเฉพาะกับระดับของเหลวที่ด้านล่างของคอลัมน์ เมื่อการทำงานของคอลัมน์เบี่ยงเบนไปจากความสมดุลของวัสดุโดยรวม อาจสะท้อนให้เห็นการเปลี่ยนแปลงในส่วนต่างของความดันคอลัมน์ ตัวอย่างเช่น หากมีวัสดุเข้ามากกว่าออก ความแตกต่างของความดันคอลัมน์จะเพิ่มขึ้น
สำหรับคอลัมน์การกลั่นแบบคงที่ ค่าความแตกต่างของความดันคอลัมน์ควรอยู่ภายในช่วงที่กำหนด หากส่วนต่างของความดันสูงเกินไป ความเร็วไอที่เพิ่มขึ้นภายในคอลัมน์จะสูงเกินไป ส่งผลให้เกิดการสะสมของหมอกอย่างรุนแรงและน้ำท่วม ขัดขวางการทำงานปกติ หากความแตกต่างของความดันน้อยเกินไป ความเร็วไอที่เพิ่มขึ้นภายในคอลัมน์จะต่ำเกินไป ส่งผลให้-ผลกระทบการถ่ายโอนมวลของเหลวของก๊าซบนถาดลดลง และยังทำให้เกิดการรั่วไหล ซึ่งทำให้ประสิทธิภาพของถาดลดลงอย่างมาก การควบคุมสมดุลของวัสดุที่ไม่ดีอาจทำให้เกิดการทำงานที่วุ่นวายของทั้งคอลัมน์ การควบคุมสมดุลของวัสดุเป็นส่วนสำคัญของการทำงานของคอลัมน์ หากความสมดุลของวัสดุปกติถูกรบกวน จะส่งผลกระทบต่อความสมดุลอีกสองอย่าง: ความสมดุลของก๊าซ-จะไม่บรรลุผลตามที่คาดหวัง และความสมดุลทางความร้อนก็จะหยุดชะงักเช่นกัน และจำเป็นต้องปรับใหม่
